七棵树镇名源于驻地七棵树村名。中华民国时期，先后隶属龙江县第三区和第二区管辖。东北沦陷后，初设七棵树乡保，1938年4月改设七棵树村。1945年“九三”抗日战争胜利后，1946年6月设置七棵树区，1948年改为第六区。1956年3月，并村划乡，设置七棵树乡。1958年6月，将青龙山乡并入七棵树乡。同年9月，与发达、福山永乡合并，成立发达人民公社。1960年从发达公社境内划出，设置七棵树公社。“文化大革命”前期，曾一度更名为“七一”公社，1970年4月恢复七棵树公社名称。1984年5月，改为七棵树乡。1986年4月，改为七棵树镇。