甘珠尔与丹珠尔的分别是:

甘珠尔又称正藏，丹珠尔则称副藏、杂藏、续部等，此系布顿对西藏大藏经所作独特之分类法，其后成为定式。其内容包含诸论师之教语、注释书、密教仪轨、记传、语言、文字等甘珠尔所未曾网罗者。

丹珠尔（西藏名：为西藏大藏经二藏之一。西藏大藏经分为教说翻译、论著翻译等两部，音译甘珠尔、丹珠尔。