牡蛎壳由无机质和有机质两部分组成。无机质部分以碳酸钙为主， 占牡蛎壳质量90%以上， 其中钙元素占 (39.78±0.23) %， 此外还含有铜、铁、锌、锰、锶等20多种微量元素。

牡蛎壳的有机成分约占牡蛎壳质量的3%～5%， 含有甘氨酸、胱氨酸、蛋氨酸等17种氨基酸。

贝壳的有机质部分又分为可溶性有机质和不溶性有机质， 其含量随贝壳种类和生长期不同而异， 一般占贝壳干质量的0.01%～10%， 其中可溶性有机质含量更少， 占0.03%～5%。