归中共中央宣传部管理。

新华书店是中华人民共和国国有图书发行企业，隶属于中共中央宣传部，中国出版集团之下，是国家官方的书店，也是国家刊物宣传与发售处之一。

新华书店总店不同时期曾直属于中央党报委员会、中央出版委员会、中央出版局、中央宣传部、国家出版总署、文化部、国家出版局、国家新闻出版总署等领导机关。

2002年4月，按照中央文化体制改革战略部署，新华书店总店成为组建中国出版集团的十二家重要成员单位之一。其发行网点遍及全国城镇，其管理机构为新华书店总店。