职能不同

大理寺具有审判职能，而且是其主要职能，但是大理石寺的审判职能是有限制性的，并不是全国范围内所有的案件都由大理寺审理。

左右金吾卫是唐代官署名称，属十六卫中的两卫，主要负责皇宫和京城的治安和巡逻，是皇帝的卫队，因此，金吾卫所破获的案件一般都是大案，要案，涉及到皇室的安危，甚至是皇帝的安全，必须交由大大理寺审理。