微马队当然是合法组织。微马队是跑步爱好者自发成立的民间非正式组织，虽然其不需要在民政部门进行登记或注册，但法律对这样民间非正式组织并没有进行严格的限制，只要其活动或行为在法律允许范围，那么其对外和对内各种行为或产生的后果都是受法律保护的。