不是啊，数学仅仅为自然科学的工具学科，通过数学中有些计算方法来解决自然科学中某些科学问题或，而化学系涉及很多专业都会用到数学算法，如有机化学，物理化学，分析化学，量子化学中会涉及数学运算，这些专业对数学功底都有着很高的要求。因为

数学很好学化学系是不是亏了

这个问题不是一概而论的，专业难不难，是看个人的兴趣和能力，数学专业适合逻辑思维能力强的人，化学专业更适合形象思维能力强的人。但兴趣是最好的老师，如果有强烈的兴趣，那就不会感觉难了。