液相色谱柱的平衡方法是以纯乙腈或甲醇作流动相，首先用低流速0.2ml/min将色谱柱平衡过夜，然后，将流速增加0.8mL/min冲洗30min以便将色谱柱的填料充分平衡至最佳状态。平衡过程中，将流速缓慢地提高直到获得稳定的基线，这样可以保证色谱柱的使用寿命，并且保证在以后的使用中，获得分析结果的重现性。