神探柯晨大结局是在同事和朋友的帮助下，柯晨抓住了阴谋背后的黑手，成功将坏人绳之以法，使自己父母的沉冤得到昭雪，也坚定了他伸张正义、寻找光明的决心。

肖德胜最后畏罪自杀。