两个词的区别在于含义不同。灵魂的意思是心灵，思想。人格。良心。如灵魂深处。出卖灵魂等。

命脉的意思是指生命和血脉。多用来比喻关系重大的事物。如经济命脉等。比如说，书籍是炎夏的凉荫，是严冬的炭火，是灵魂的伊甸园，所以我们有多读书，读好书。