5w40柴油机油农用柴油三轮车夏天是可以用的。5w40有三个含义：

一是5w代表该机油的冬季低温适用温度，5w表示该机油可以在冬季-30℃的环境温度下使用。

二是40代表该机油的夏季适用温度，40表示这款机油可以在夏季+40℃都环境温度下使用。

三是5w40代表该机油是四季通用型机油，可以在上述温度区域内四季通用。

因此，5w40柴油机油农用三轮夏天是可以用的。