两弹一星难度更大。因为两者相比，研制两弹一星的当时，中国所处的国际环境更恶劣，国内能动员的力量也更薄弱。

题外话，对于一个大国而言，难度再大，也必须有自己的战略威慑力量，相比之下航母只是战术打击平台，充其量是小型战区威慑。处身于二战后冷战前的紧张对峙时期，所以优先发展两弹一星是必要的。