吴三桂没有放走朱国治，而是将其杀掉。吴三桂欲率部反叛时，朱国治担任云南巡抚，由于康熙帝推进撤藩，吴三桂决定起兵反叛。

作为康熙帝派往云南监视吴三桂的关键人物，朱国治竟对吴三桂的反叛图谋毫无察觉，直到吴三桂举兵反叛，邀请朱国治参与，他才如梦方醒，明确拒绝，吴三桂随即杀死朱国治。