上清派没有被灭门，被灭门的三一门。

三一门是被无根生给气死的，由于复仇成了灭门，如今“三一门”的弟子仅剩下了陆瑾，其他人也都因为这次复仇而被杀死，“三一门”从此就在异人界消失了。而导致被灭门的关键除了无根生之外，陆瑾等人的复仇也是主要原因之一。