不一样，消毒只要求杀灭或清除致病微生物，使其数量减少到不再能引起人发病。防疫是要灭菌，不仅要求杀灭或清除致病微生物，还要求将所有微生物全部杀灭或者清除掉，包括非致病微生物。总之，消毒只要求场所与物品达到无害化水平，而防疫则要求达到没有一个活菌存在，这里面就包括一些细菌芽孢，病毒，真菌，支原体，衣原体等。