玉髓和燧石主要区别是结构和形状不一样。

玉髓是一种矿物，又名“石髓” ，玉髓其实是一种石英，它是石英（隐晶质）的变种。它以乳状或钟乳状产出，常呈肾状、钟乳状、葡萄状等，具有蜡质光泽。

燧石，俗称火石，又称燧石岩。一种致密坚硬的硅质沉积岩。主要矿物成分为玉髓和微晶石英，有时有蛋白石，颜色暗淡无光彩，常为浅灰至褐黑等色。