1、科属区别：骨鳝属于鳗鲡目鳗鲡科，刺鳝则属于合鳃鱼目合鳃鱼科。

2、颜色区别：骨鳝背部上端灰黑下端绿，刺鳝背部是黄褐色。

3、鳞片区别：骨鳝有不太明显的鳞片，刺鳝没有鳞片。

4、生活环境区别：骨鳝有时在海水活动，有时在淡水，刺鳝一般一直在淡水中活动。