赤腹松鼠对林木的危害发生在12-6月，危害严重期是4、5两个月，主要危害树种为柳杉、杉木。

通过对其胃内容物的解剖分析，其为植食性啮齿动物，偶尔也取食昆虫，其食物组成有明显的季节性变化，由春季非常单一到夏、秋季逐渐丰富，到冬季再度单一。