万能鱼药与硝化细菌有冲突。俗话说是药三分毒，而鱼药也不例外。更不要说所谓的万能鱼药了。这样的万能鱼药，其中一定包含很多药物成分。而这些药物成分对于各种细菌都有非常强的杀灭作用。而硝化细菌就是细菌的一种，所以万能鱼药与硝化细菌是冲突的。