广州东站是广州重要的交通枢纽，在高铁没有开通前，广州到深圳最快的交通工具，就是和谐号。

后来高铁开通，番禺，海珠，荔湾这边的居民到深圳，坐交通工具的情况下，主要选择广州南站。白云，天河一部分，越秀一部分选择广州东站，坐和谐号去深圳。

随着高铁普及，广州东站以及以前的老广州火车站建成开通。一部分到广州南站高铁列车会停靠广州东站以及老火车站。广州东站将会成为非常重要的交通枢纽，极大缓解南站目前的拥堵。

因此，深圳是否可以去广州东站中转，主要在于去的地方。目前来讲，去白云，天河，越秀，从化，花都等，还是通过广州东站比较好。如果是长途中转，目前还是建议南站方便一些。尽管东站会有到全国很多地方的普快。但是从车次密集程度，行车的速度，还有始发全国各站，没有南站有优势。