火影忍者中的羽衣杀掉羽村的原因是：第一个原因是羽村被自己的母亲大筒木辉夜控制了，为了拯救弟弟，羽衣只能和弟弟大战，最终狠心杀死了羽村，开启了轮回眼，第二个原因是羽衣有蛤蟆丸送的复活符咒，在杀死了羽村后就使用这个符咒复活了羽村，可以说羽衣是有备无患，才选择击杀已经被控制的弟弟羽村。