网约车停运损失的赔偿是按照网约车司机的营运利润进行赔付的。营运利润的计算方式为营运收入-营运成本最后所得即为赔偿的损失。不仅是赔偿停运费，还需要赔偿网约车误工费。

如果经过核实，对方的网约车属于正规的网约车并且取得经营许可证的，那么根据法律规定就应当赔偿误工费。