没有长圳站。

13号线共设站16座，站名分别为：上屋北站、宝石路站、罗租站、应人石站、白芒站、留仙洞站、石鼓站、西丽火车站、松坪站、科兴站、深大站、深大东站、科苑站、后海站、登良东站、深圳湾口岸站，其中换乘车站11座。全部为地下线，线路两端均预留延伸条件。沿线设内湖全地下停车场，出入线与登良东站接轨。