千年古莲的莲子有一层坚硬的外壳，可以防止水分和空气的内渗和外泄。古莲子上有一个小气孔，里面贮存着氧气，二氧化碳和氮气。同样，里面还含有少量的水分和丰富的营养成分，具有极强的生命力，这也是千年古莲过去这么久还能开花的原因。