有区别。垫基是为了使基础更为牢固的一种措施，而奠基则是一种仪式，两者有着本质的区别。垫基往往是基础比较软弱，釆取一种加固地基的工程措施，从而使地基增加地基应力，使基础更为坚固。

奠基是针对某项重大工程的开工，组织有相关领导、相关部门参加的一种开公仪式，在开工仪式上举行的奠基活动。