真玛瑙透明度不如人工合成的好，稍有混沌，有的可看见自然水线或“云彩”，而人工合成的玛瑙透明度好，象玻璃球一样透明。

天然玛瑙石手感凉，表面像涂了一层蜡，并有蜡的光泽，蜡状光泽，半透明至透明。表面平坦光滑，玻璃光泽有的较凹凸不平，蜡状光泽。