合肥工业大学最好的学院是汽车学院和电气自动化学院。

合肥工业大学是中华人民共和国教育部直属的全国重点大学，由教育部、安徽省人民政府、工业和信息化部和国家国防科技工业局共建，是国家“双一流”建设高校。汽车学院和电气自动化学院是合工大的最好的学院。