我认为两者之间的主要区别是两者的概念不同，履行职责目的也不同。第三方检测是指具备有检测资质专门从事检测工作的公司，受监督部门或者施工单位、建设单位委托对工程进行的检测，其检测具有法律效力。而施工检测一般是施工单位为了施工所作的自我检测，不具备法律效力。