南阳火车站停运的原因很多，但主要有以下几点：

1、因为不可抗拒力譬如：洪水、地震、泥石流、塌方等因素造成的铁路运输线路中断，在短时间内无法抢修、恢复。

2、因为疫情等因素造成的城市封控，以至于交通中断

3、因为战备需要而进行的交通临时管制需要。