one是一个的意思，可以作为数词，也可以指代某人或者某物，作为指示代词用。one on one是某物在某物之上，表示位置，如果放在不同的句子中就会有不同的指代。one by one是一个挨着一个，表示顺序，一般放在句子谓语后边，修饰谓语动作。二者是通过不同的介词表达不同的意思。