九段沙自然保护区未来将作为得用途有以下几个方面:

1、为人类提供研究自然生态系统的场所。 

2、提供生态系统的天然“本底”。对于人类活动的后果，提供评价的准则。 

3、是各种生态研究的天然实验室，便于进行连续、系统的长期观测以及珍稀物种的繁殖、驯化的 研究等。  

4、是宣传教育的活的自然博物馆。 　 

5、保护区中的部分地域可以开展旅游活动。  6.能在涵养水源、保持水土、改善环境和保持生态平衡等方面发挥重要作用。