摩托车有牌有证的情况下派出所无权扣留。
法律依据:《中华人民共和国道路交通安全法》 
第十一条 驾驶机动车上道路行驶,应当悬挂机动车号牌,放置检验合格标志、保险标志,并随车携带机动车行驶证。
任何单位和个人不得收缴、扣留机动车号牌。
第十九条 驾驶机动车,应当依法取得机动车驾驶证。
公安机关交通管理部门以外的任何单位或者个人,不得收缴、扣留机动车驾驶证
派出所可以扣留摩托车吗
因为当时你没有任何证件,没有材料证明摩托车的来源。派出所民警有权暂时扣留车,但要开扣条,也是摩托车被扣的凭证。没开扣条,涉嫌程序违法,驾驶证过期跟这件事没有关系,只要你有材料证明摩托车是合法的就行。过一周回来那民警就是侵范你使用摩托车的权力,你可以试着找派出所的领导说明情况。