黄铁矿是自然界中铁同位素最重要的矿物。

铁有四种稳定同位素，分别是Fe-54、Fe-56、Fe-57和Fe-58，四种同位素在自然界中丰度分别为5.8%、91.72%、2.1%、和0.28%，另外还有两种放射性同位素Fe-55和Fe-59，半衰期分别是2.7年和44.5天。

其中铁-59还常作为示踪剂，能让医疗人员追踪人体代谢的情况，对某些疾病的治疗和药物追踪有着重要意义。