朱鹮是雌雄同型的鸟类，雌雄个体颜色及体型相似，其性别从形态学特征上很难区分。

准确简便的对朱鹮进行性别鉴定，将有助于对这一濒危物种进行深入研究和实施有效的保护措施，如野生种群在不同气候和食物压力下出生个体的性比变化、饲养种群的提前分群饲养和科学配对、再引入释放个体的正确选择等。已有的从外部形态特征如体重，喙长等鉴别朱鹮性别的的方法仍存在争议。目前，只能根据饲养人员的经验和交配行为来区分朱鹮成鸟的性别，对于野生及尚无交配行为的笼养幼鸟，则难以准确地鉴定性别。