使用范围不同：中性腻子广泛用于室内墙面上，而耐水腻子广泛用于室外墙面上，特别是潮湿区域更是需要使用。

环保性不同：中性腻子的添加剂是水，因此一般都是环保无毒的，耐水腻子的环保性则会更差一些。

性能不同：中性腻子可以溶于水，耐水腻子不可溶于水。