北京协和研究院就是北京协和医学院研究院，成立于1986年7月。

北京协和医学院、中国医学科学院实行院校合一的管理体制，相互依托，优势互补，教研相长，面向全国，承担着科研、教学、医疗三大任务。研究院是首批具有博士学位和硕士学位授予权的单位。