芽变的原因可能是长期受到自然界中各种射线的照射和过冷、过热等外界的刺激，导致的。变异的方向可以涉及各个方面，如节间变短、株型变矮、果形改变、色泽变红、成熟变早或变晚等。

当某株树的某一个芽原基发生变化后，一般要等到它发芽、抽枝、长叶，乃至开花、结果后才能被察觉。因此，“芽变”往往成了“枝变”或“株变”后才被确认。