两者品质和成分都一样，港版和国行合生元益生菌区别有这几个方面：港版合生元益生菌只有一个系列，就是合生元益生菌冲剂而国行合生元益生菌不仅有合生元益生菌冲剂，还有合生元儿童益生菌粉、合生元益生菌饮料，比港版的多了两种产品，有多种选择，当然效果都是一样的。而港版合生元益生菌冲剂和国行合生元益生菌冲剂有几个不同点，港版合生元益生菌冲剂只有一种口味，国行合生元益生菌冲剂有奶味和原味。

包装袋装数不同，港版的是30袋，国行的有两种包装，分别是26袋和48袋。