熊出没怪兽计划的背景是这样的，天才威博士无意中发现一个天外陨石，他可以吸取别的动物的天赋与能力。他就想到运用这块石头的力量，通过吸取别的动物的能力，来使自己的机器无敌怪兽变成最强。

熊大熊二和光头强发现了他的阴谋，并为了保护动物，与他不断作对，期间发生的一系列故事。