区别一、释义不同

峡谷:狭而深的谷地。

深渊:深潭,也指悬崖、深谷。

区别二、引证解释不同

峡谷:碧野 《天山景物记》:“春天繁花开遍峡谷,秋天果实压满山腰。” 

深渊:《诗·小雅·小旻》:“战战兢兢,如临深渊,如履薄冰。”