一是内部不团结，祸起萧墙。众所周知，陈友谅是通过杀害徐寿辉正式夺取西系红巾军的天完政权。由于名不正言不顺，因此招来了很多人的不满，不少天完将领都率部转投朱元璋。面对将领叛变，他没有及时整顿内部导致上下互相猜忌从而使其内部的号令不统一。

二是战略上失利，一败涂地。陈有谅出动60万大军、楼船数百艘进攻朱元璋。本当一路挺进直取应天府。然而他却以大军包围洪都府，数月久攻不下，平白浪费良机，仗着兵力强大也没注意侧翼的安全，受到朱文正的攻击。