注册公司一般都是有限责任公司，是由一个或若干个股东组成，有企业章程和法律保护与约束，法律层面上负有有限责任小作坊一般都是家庭或自然人独资经营属于个人独资或个体工商户一类，经营灵活，在法律层面上负有无限责任。区别主要是一个是负有限责任另一个负无限责任。