无人深空远征模式飞船会继承，无人深空二周目继承。也就是玩家在开启二周目后，玩家的武器、资源以及舰船都是可以继承的。但是玩家建造的基地不会在二周目内显示，舰船和武器在二周目是损坏状态，需要玩家通过材料修理后才可以继续使用。

玩家在完成一周目的所有任务后，会进入希尔伯特纬度，这相当于游戏的新空间。虽然找不到已经建设好的基地，但是玩家可以通过建造传送门的方式返回1周目的基地，来获取资源。