马来巨龟的生长速度快。一般体重达4千克时，已能产卵，每年5-10月间产卵。人工加温饲养条件下，12月至次年3月也有产卵现象。卵重46~72克，卵是细长形的有易碎的硬壳，长径60~80毫米，短径35~43毫米。稚龟背甲长60毫米，甲壳上有很粗糙的纹理，背甲后部有明显的锯齿状边缘。加温饲养下，马来巨龟有不产卵的现象。

对卵的生态学和行为学方面知之甚少。虽然野生环境中的食物尚不知道，但在人工饲养下，这种龟的食物包括植物和动物饲料，不管是水生的还是陆生的。