两者的性质，化学结构不同。木聚糖酶是一种存在于植物细胞壁中的异质多糖，是植物半纤维素的主要成分。大多数木聚糖酶是一种结构复杂的、具有高度分枝的异质多糖，含有许多不同的取代基，木聚糖酶是一组酶，而非一种酶。而木糖醇是一种有机化合物，是从白桦树、橡树、玉米芯、甘蔗渣等植物原料中提取出来的一种天然甜味剂，也是人们身体正常糖类代谢的中间体。