火影忍者宁次的父亲会死的原因是：宁次的父亲日向日差杀死了前来绑架日向雏田的云隐村的人，结果导致了云隐村对木叶村打动了大战，为了平息战火，日向家族居然满足了云隐村的无理要求，交出了日差，导致了日向宁次的父亲日差的最终死亡。