化妆品放在海关一般不会变质。生活中的化妆品是有一定的保质期的，通过海关邮寄或者运送的化妆品，如果没发现问题，海关会在很短时间内放行，是不会影响化妆品质量的，但遇到无人认领的化妆品，会在海关存放很长时间，可能会过保质期，化妆品有可能就会变质。