因为在数亿或数十亿年前，贵州铜仁现在所踩的大地都是海洋。

随着地壳运动、海平面上升，才有了高山和大地。

梵净山作为武陵山脉的主峰，也是最先演变为高地的山峰之一。

梵净山景区的蘑菇石，主要是受到水、风、生物等因素风化、侵蚀而行程的，贵州大部分地理地貌是是以喀斯特地貌为主，而梵净山景区就是典型的喀斯特地貌，石质以石灰岩及沉积岩为主，特别容易受到侵蚀，所以看起是一层一层的。

梵净山蘑菇石的上大下小，是因为下部比上部石头侵蚀的严重些，所以形成了现今的蘑菇状形态。