京东店铺缴纳保证金的操作方法：

1、首先网上打开京东官网网站，进入网站后，在网页的最下放找到“商家入驻”点击进入。

2、在打开的第二个页面后，需要先登录账号。如果没有京东商城的账号，此时点击先注册一个账号，然后需要了解注册账号协议，点击同意，进行注册。

3、注册完之后，然后登录进去，然后在右边找到“客户服务”，点击之后，再在弹出的菜单选择“商家后台”进入。

4、入驻京东商家，点击进入。然后在当前界面，选择自己要入驻的类型，有三个，选择一个。