区别主要体现在：载种历史不同、品种不同。

载种历史不同：新余蜜桔是近十几年通过引进改良的，可谓后起之秀。南丰蜜桔有1200多年的栽种史，可谓历史悠久。

品种不同：新余蜜桔，果肉爽脆、无渣无核、汁多味甜，富含多种维生素、微量元素、矿物质、有机酸等，对人体健康有利，有“无公害健康食品”之称。南丰蜜桔，素以皮薄、核少、味浓、香甜著称。